RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIO	O75962	3097 aa		13.99	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989		M0R2N6	131 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	LPXN	O60711	386 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP4A	P20648	1035 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOSB	P53539	338 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPY5R	Q15761	445 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989		Q4G0T1	1027 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	WASF1	Q92558	559 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	HLA-C	Q95604	372 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD52	P31358	61 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	NME8	Q8N427	588 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	RIT2	Q99578	217 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	COL1A2	P08123	1366 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENPP3	O14638	875 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	MARCH6	O60337	910 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP3A7	P24462	503 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	JAK3	P52333	1124 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRB10	Q13322	594 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMD10	O75832	226 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	SFN	P31947	248 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRT2	P35908	639 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRE11	P49959	708 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC37A4	O43826	429 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	JAK2	O60674	1132 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	OAT	P04181	439 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERVK-21	P61565	698 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	PAK2	Q13177	524 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM29	Q14134	588 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	UGCG	Q16739	394 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NEDD4L-233	ENST00000591989	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.94	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms