RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP1A3P13637 1013 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC26A2P50443 739 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF131P52739 623 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SMTNP53814 917 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMCX2Q7L311 632 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SFR1Q86XK3 245 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 KIFAP3Q92845 792 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ASTN1O14525 1302 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TLR2O60603 784 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 DGAT1O75907 488 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GCNT3O95395 438 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SP4Q02446 784 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMC2Q13753 1193 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ODR4Q5SWX8 454 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SOCS4Q8WXH5 440 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP170P1Q96L14 293 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TSKSQ9UJT2 592 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PLXNB2O15031 1838 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 N4BP3O15049 544 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GTH6 734 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PDXKO00764 312 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CETN3O15182 167 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HIP1RO75146 1068 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 OATP04181 439 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RFC5P40937 340 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TM4SF4P48230 202 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKCEQ02156 737 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 NOGQ13253 232 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TMC6Q7Z403 805 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CPA4Q9UI42 421 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PLS3P13797 630 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 STAT5BP51692 787 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM14Q14142 442 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HVCN1Q96D96 273 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCDQ96DY2 449 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT74Q96LB3 600 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FGD4Q96M96 766 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 AOC2O75106 756 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 GH1P01241 217 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP2K2P36507 400 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 RTP1P59025 263 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SP2Q02086 613 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 VSTM4Q8IW00 320 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 HPS3Q969F9 1004 aa24.96■■□□□ 1.59
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