RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC6Q6W4X9 2439 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM86B1E9PN63 330 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB43O43298 467 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HBP1O60381 514 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GLP2RO95838 553 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL18Q96ME1 805 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf42Q9H799 3197 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIA3O75145 1194 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA5O75582 802 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF76P36508 570 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM160B1Q5W0V3 765 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 COL1A2P08123 1366 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB42B2RXF5 422 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP4AP20648 1035 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC27P30260 824 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 COASYQ13057 564 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF20Q5VTR2 975 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PDXDC2PQ6P474 469 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R16BQ96T49 567 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM2Q99965 735 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF302Q9NR11 478 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS18Q9NS28 235 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HCSTQ9UBK5 93 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8AA7E2F4 631 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8BA8MQT2 603 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND3A2RUS2 1198 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C9IYK1 514 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 NHLH1Q02575 133 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF484Q5JVG2 852 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SWSAP1Q6NVH7 229 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RASEFQ8IZ41 740 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS3O15072 1205 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf31O95567 290 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM10P98175 930 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 OSMRQ99650 979 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GLT8D2Q9H1C3 349 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH6Q9H252 994 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.15■■■□□ 2.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM228AQ86W67 206 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 EDAQ92838 391 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TLE6Q9H808 572 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC730098B7Z3J9 87 aa29.13■■■□□ 2.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 TLR9Q9NR96 1032 aa29.13■■■□□ 2.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR32O75388 356 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVFC1P60507 584 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.11■■■□□ 2.25
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