RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.69■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.69■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SFI1A8K8P3 1242 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 HIP1RO75146 1068 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 RGS20O76081 388 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 HOXD13P35453 343 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MOB2Q70IA6 237 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 POTEB2H3BUK9 544 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 PSAPP07602 524 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 FIZ1Q96SL8 496 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SNAPC2Q13487 334 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 DRC1Q96MC2 740 aa24.67■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 NR3C1P04150 777 aa24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MAPK7Q13164 816 aa24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.66■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MOGSQ13724 837 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MEA1Q16626 185 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ASTN1O14525 1302 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 PLS3P13797 630 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 EDNRBP24530 442 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 CDK17Q00537 523 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MYBPC2Q14324 1141 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 DAW1Q8N136 415 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 ZNF592Q92610 1267 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 PNMA3Q9UL41 463 aa24.65■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 MYH11P35749 1972 aa24.64■■□□□ 1.54
USP36-218ENST00000590546 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 RASSF10A6NK89 507 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 CNMDO75829 334 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 UQCRHP07919 91 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ERVK-24P63145 666 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 UGCGQ16739 394 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 XKR9Q5GH70 373 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 NEK11Q8NG66 645 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 STRA6Q9BX79 667 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 GBP3Q9H0R5 595 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 TMEM206Q9H813 350 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 TGFB1I1O43294 461 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 PPP1R37O75864 691 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 FKBP1BP68106 108 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 CNTN2Q02246 1040 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 POLD4Q9HCU8 107 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 LCTP09848 1927 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.63■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 TGFB3P10600 412 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ERCC3P19447 782 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 MTF1Q14872 753 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 MROH8Q9H579 483 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 KLK7P49862 253 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ACTR2P61160 394 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.62■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.61■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.61■■□□□ 1.53
USP36-218ENST00000590546 BACH1O14867 736 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms