RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO5Q75V66 913 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MYCT1Q8N699 235 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP5P51878 434 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMCX2Q7L311 632 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNL1Q8IU54 200 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP63Q96MT8 703 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 STRA6Q9BX79 667 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ARIH2O95376 493 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MYBP10242 640 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXD13P35453 343 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 XKR9Q5GH70 373 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 XKR3Q5GH77 459 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 VTA1Q9NP79 307 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF302Q9NR11 478 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SFI1A8K8P3 1242 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PDXKO00764 312 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GGPS1O95749 300 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKCEQ02156 737 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 DRC1Q96MC2 740 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID2Q68CP9 1835 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 N4BP3O15049 544 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX33O43247 280 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R37O75864 691 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PLS3P13797 630 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SREBF2Q12772 1141 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ALCAMQ13740 583 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL4Q14679 1199 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NFIL3Q16649 462 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6KQ17RY6 165 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf99Q6UX52 265 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SCFD2Q8WU76 684 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PCYT2Q99447 389 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CPA4Q9UI42 421 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS16A8MUM7 142 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LGR5O75473 907 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GCNT3O95395 438 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GNA14O95837 355 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP4AP20648 1035 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TM4SF4P48230 202 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 NPEPPSP55786 919 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SP4Q02446 784 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ODR4Q5SWX8 454 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 KATNBL1Q9H079 304 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM3APO60318 1980 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH11P35749 1972 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM150BA6NC51 233 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 OATP04181 439 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MORN1Q5T089 497 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP170P1Q96L14 293 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR20Q99678 358 aa25.13■■□□□ 1.61
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