RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 NAALADL2Q58DX5 795 aa22■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 PDXDC2PQ6P474 469 aa22■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ADAMTS3O15072 1205 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ITGB1P05556 798 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ALADP13716 330 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 CPA1P15085 419 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 DNAJB1P25685 340 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.111e-10■■■■□ 26.4
TRAF4-216ENST00000586813 GATMP50440 423 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 APOBRQ0VD83 1088 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 CLUL1Q15846 466 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 UIMC1Q96RL1 719 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 PRR33A8MZF0 331 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 LINC01565O15544 149 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 MGEA5O60502 916 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 RPS6KA5O75582 802 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ATP4AP20648 1035 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 IGFLR1Q9H665 355 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 MBTPS2O43462 519 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 DCXO43602 365 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 MCTP2Q6DN12 878 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 Q6ZUG5 572 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 KCNB2Q92953 911 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 BRF1Q92994 677 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 C6orf50Q9HD87 102 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 C22orf31O95567 290 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 IRS1P35568 1242 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 PKN1Q16512 942 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 POF1BQ8WVV4 589 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-216ENST00000586813 DENND3A2RUS2 1198 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 NDUFV1P49821 464 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 ADAM15Q13444 863 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 KIZQ2M2Z5 673 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 ODR4Q5SWX8 454 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 OSMRQ99650 979 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 ADAM2Q99965 735 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 RGS18Q9NS28 235 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 CD207Q9UJ71 328 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 GPR182O15218 404 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PSAPP07602 524 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 GNA11P29992 359 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA4P34932 840 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PRR16Q569H4 304 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PHKBQ93100 1093 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 C9IYK1 514 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 VTNP04004 478 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 FAM228AQ86W67 206 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 FBXL16Q8N461 479 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 METTL13Q8N6R0 699 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-216ENST00000586813 EFHBQ8N7U6 833 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms