RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 UGCGQ16739 394 aa23.7■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 METTL13Q8N6R0 699 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAP23-216ENST00000568331 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.7■■□□□ 1.38
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.69■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 CALCRLQ16602 461 aa23.69■■□□□ 1.38
SNAP23-216ENST00000568331 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.69■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 C22orf31O95567 290 aa23.68■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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SNAP23-216ENST00000568331 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.62■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.62■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.62■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 DNM2P50570 870 aa23.61■■□□□ 1.37
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SNAP23-216ENST00000568331 DYDC2Q96IM9 177 aa23.61■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 LXNQ9BS40 222 aa23.61■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.61■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 MYO9BQ13459 2157 aa23.6■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM150BA6NC51 233 aa23.6■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 H3BQV1 296 aa23.6■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 ENPP3O14638 875 aa23.6■■□□□ 1.37
SNAP23-216ENST00000568331 STBD1O95210 358 aa23.6■■□□□ 1.37
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