RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A087WWV3 80 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PP2D1A8MPX8 630 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 C22orf31O95567 290 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SELPP16109 830 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC25AP30304 524 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPAQ15257 358 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTSHP09668 335 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHB4P54760 987 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPEPPSP55786 919 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID2Q68CP9 1835 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRD1O95696 1058 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL13Q8N6R0 699 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 LYPLA2O95372 231 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACRP10323 421 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPA1P27694 616 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP170P1Q96L14 293 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP89Q96ST8 783 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPH10BP0C881 870 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIN1Q05586 938 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECM1Q16610 540 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEGQ6S5H5 508 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPH3Q86UC2 560 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRO3102Q9H379 93 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEB2O15479 319 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPNMBQ14956 572 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 XKR9Q5GH70 373 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPAINQ86UA6 219 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TET1Q8NFU7 2136 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWCEQ96DN2 955 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL23AQ9NPF7 189 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIP14410 1827 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAND2O75155 1236 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHRNA1P02708 482 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP8BP34820 402 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLCN3P51790 818 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBTPS1Q14703 1052 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC39A14Q15043 492 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT79Q5XKE5 535 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBNO60934 754 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK24Q9Y6E0 443 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFC2P35250 354 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK38Q15208 465 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM26DQ5JW98 314 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 NACC1Q96RE7 527 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 VTNP04004 478 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 MGAT3Q09327 533 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 DRP2Q13474 957 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 NME8Q8N427 588 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 20.1
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.2 ms