RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GCNT4	Q9P109	453 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK3	O14649	394 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FAM13A	O94988	1023 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP58	Q5T655	872 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	NFU1	Q9UMS0	254 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	UBE4B	O95155	1302 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	OPLAH	O14841	1288 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ECE2	O60344	883 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RSPH10B	P0C881	870 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	IFT81	Q8WYA0	676 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GH2	P01242	217 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	IRAK1	P51617	712 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	NPEPPS	P55786	919 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	H2AFV	Q71UI9	128 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	IQCK	Q8N0W5	287 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SIX2	Q9NPC8	291 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	NENF	Q9UMX5	172 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		20.11	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	STAT1	P42224	750 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	STAT2	P52630	851 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R5C	Q13362	524 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	20.1	■□□□□ 0.81	2e-6	■■■■■ 29.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZIM3	Q96PE6	472 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PARVG	Q9HBI0	331 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KCND2	Q9NZV8	630 aa		20.1	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	EP400	Q96L91	3159 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	EML1	O00423	815 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CASP4	P49662	377 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SKOR1	P84550	965 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CD302	Q8IX05	232 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MYCT1	Q8N699	235 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	BORCS6	Q96GS4	357 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FAM107B	Q9H098	131 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RGL1	Q9NZL6	768 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TGFB1I1	O43294	461 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CUL1	Q13616	776 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SCFD2	Q8WU76	684 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SHTN1	A0MZ66	631 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC2	O15247	247 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SLITRK3	O94933	977 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MMP10	P09238	476 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC172	P0C7W6	258 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC188	H7C350	402 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RAD51C	O43502	376 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD10	O75832	226 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2M	P0CAP2	368 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PEX26	Q7Z412	305 aa		20.08	■□□□□ 0.8

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