RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.77□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SCDO00767 359 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 AMHP03971 560 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 MMEP08473 750 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CR2P20023 1033 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SEC23AQ15436 765 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 FUKQ8N0W3 1084 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ADOQ96SZ5 270 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 WIZO95785 1651 aa6.76□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SYNJ1O43426 1573 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CDC14BO60729 498 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 Q8N1X5 172 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 WNK4Q96J92 1243 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJC7Q99615 494 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 BTBD2Q9BX70 525 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.75□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 FZD7O75084 574 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 MPIG6BO95866 241 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 COMTP21964 271 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ECE1P42892 770 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 STILQ15468 1287 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 HIPK4Q8NE63 616 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 OR14A2Q96R54 314 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 AMNQ9BXJ7 453 aa6.74□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ARHGAP6O43182 974 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 RAD17O75943 681 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 CD83Q01151 205 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 RBL2Q08999 1139 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 TM4SF20Q53R12 229 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 USP51Q70EK9 711 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ASB15Q8WXK1 588 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 GBP4Q96PP9 640 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 OR10A5Q9H207 317 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.73□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 FOXP2O15409 715 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 NFYCQ13952 458 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PCOLCEQ15113 449 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 TBR1Q16650 682 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 AGBL4Q5VU57 503 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 KANK2Q63ZY3 851 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 BRAPQ7Z569 592 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SCLYQ96I15 445 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 TOPBP1Q92547 1522 aa6.71□□□□□ -1.33
RUFY3-215ENST00000515479 A0A0G2JNJ9 132 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SLC12A8A0AV02 714 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MATN2O00339 956 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CYR61O00622 381 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 HIP1RO75146 1068 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MRE11P49959 708 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MEOX1P50221 254 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 NRN1LQ496H8 165 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 USP30Q70CQ3 517 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 Q9UFV3 132 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 WDR97A6NE52 1622 aa6.71□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ACVRL1P37023 503 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MOGSQ13724 837 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SOGA3Q5TF21 947 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms