RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.9□□□□□ -0.34
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RNF4-218ENST00000513284 ADAM2Q99965 735 aa12.9□□□□□ -0.34
RNF4-218ENST00000513284 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.9□□□□□ -0.34
RNF4-218ENST00000513284 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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RNF4-218ENST00000513284 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 KCNT2Q6UVM3 1135 aa12.89□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 CASD1Q96PB1 797 aa12.89□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 SENP2Q9HC62 589 aa12.89□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 PLCB4Q15147 1175 aa12.88□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 TMC7Q7Z402 723 aa12.88□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
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RNF4-218ENST00000513284 GINS2Q9Y248 185 aa12.85□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 ACACBO00763 2458 aa12.84□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 KRT17Q04695 432 aa12.84□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RNF4-218ENST00000513284 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa12.84□□□□□ -0.35
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