RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 HMGXB3Q12766 1538 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 H7C1D1 291 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 B4GALT3O60512 393 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 CUTAO60888 179 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KRT37O76014 449 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 F2P00734 622 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 HSD3B2P26439 372 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 POLD1P28340 1107 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 MC4RP32245 332 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 NEK4P51957 841 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KIF11P52732 1056 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 SURF1Q15526 300 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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PDE4D-220ENST00000512069 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 HIPK4Q8NE63 616 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 IFT57Q9NWB7 429 aa6.61□□□□□ -1.35
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PDE4D-220ENST00000512069 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 GYS2P54840 703 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 IL13RA1P78552 427 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF174Q15697 407 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 SDE2Q6IQ49 451 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 CALML6Q8TD86 181 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 E2F7Q96AV8 911 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 C16orf92Q96LL3 132 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 OR10A5Q9H207 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF536O15090 1300 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 A0A087X0B3 334 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 K7ESM1 405 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KPNA6O60684 536 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 ITGB3P05106 788 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 CSF2RBP32927 897 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 PPP2CBP62714 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 PPP2CAP67775 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KANK2Q63ZY3 851 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 NME9Q86XW9 330 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 WDR48Q8TAF3 677 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
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PDE4D-220ENST00000512069 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-220ENST00000512069 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.58□□□□□ -1.36
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PDE4D-220ENST00000512069 PLATP00750 562 aa6.58□□□□□ -1.36
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PDE4D-220ENST00000512069 DSG1Q02413 1049 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 EPHA7Q15375 998 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 FOXB1Q99853 325 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 OXSMQ9NWU1 459 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGEF11O15085 1522 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 WDR62O43379 1518 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 GAS7O60861 476 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 IGSF3O75054 1194 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 SLC9A1P19634 815 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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PDE4D-220ENST00000512069 CD83Q01151 205 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 ADCY1Q08828 1119 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 EFEMP1Q12805 493 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 NXPE1Q8N323 547 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 MAML3Q96JK9 1138 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 SCYL1Q96KG9 808 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 LAMTOR5O43504 91 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 ETV4P43268 484 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 EPHB4P54760 987 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 NFKB2Q00653 900 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 MOGSQ13724 837 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-220ENST00000512069 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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