RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM173BQ6P4H8 233 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 NACC1Q96RE7 527 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 C22orf31O95567 290 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 IQCF3P0C7M6 154 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGB8P26012 769 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 PKP1Q13835 747 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC39A14Q15043 492 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPAQ15257 358 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 ANO5Q75V66 913 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 USP28Q96RU2 1077 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 GDF15Q99988 308 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP26B1Q9NR63 512 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 TANC1Q9C0D5 1861 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 M0QZ92 97 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 YEATS4O95619 227 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RFC5P40937 340 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 IL17AQ16552 155 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 MTERF2Q49AM1 385 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 IER5Q5VY09 327 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 GAS2O43903 313 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 STK38Q15208 465 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM26DQ5JW98 314 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC7A3Q8WY07 619 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP170P1Q96L14 293 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RSPH10B2B2RC85 870 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 MED24O75448 989 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RSPH10BP0C881 870 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 DNM2P50570 870 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL23P55773 120 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC42EP1Q00587 391 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP7D2Q96T17 732 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 EVPLQ92817 2033 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 XKR9Q5GH70 373 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF618Q5T7W0 954 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL13Q8N6R0 699 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 WNT8BQ93098 351 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 IL23AQ9NPF7 189 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP6R2O75170 966 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 MAFO75444 373 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CSF2RAP15509 400 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 UBA7P41226 1012 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP89Q96ST8 783 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPC1 479 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 PLA2G4FQ68DD2 849 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 SPTLC2O15270 562 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 DGAT1O75907 488 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 DDIT3P35638 169 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 RARRES1P49788 294 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 HYIQ5T013 277 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 TCP11Q8WWU5 503 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 CALML4Q96GE6 196 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 SCLYQ96I15 445 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 DNM3Q9UQ16 869 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 SQORQ9Y6N5 450 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 ARID2Q68CP9 1835 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-212ENST00000508338 TXLNAP40222 546 aa29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms