RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 SQORQ9Y6N5 450 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MGAT3Q09327 533 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ODR4Q5SWX8 454 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP7D2Q96T17 732 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 BANK1Q8NDB2 785 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 HAS1Q92839 578 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 VAV3Q9UKW4 847 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 GINS2Q9Y248 185 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF862O60290 1169 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 C22orf31O95567 290 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 LPIN1Q14693 890 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 EPHA7Q15375 998 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 UGCGQ16739 394 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 GUCD1Q96NT3 240 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD9AQ99638 391 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 H3BQV1 296 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MYOGP15173 224 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MCM7P33993 719 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TXKP42681 527 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 DNM2P50570 870 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB103AP81534 67 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 PAK2Q13177 524 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 AKT3Q9Y243 479 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 EML1O00423 815 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 GJB5O95377 273 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 CA3P07451 260 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAPPC10P48553 1259 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIN2CQ14957 1233 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 TCTN1Q2MV58 587 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MTERF2Q49AM1 385 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 MCTP1Q6DN14 999 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 INSL6Q9Y581 213 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-210ENST00000505941 FOSL2P15408 326 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 GJB2P29033 226 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC42EP1Q00587 391 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 MYLIPQ8WY64 445 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS6KA5O75582 802 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 UPP2O95045 317 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 CD52P31358 61 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC38Q5R3I4 469 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 TPH2Q8IWU9 490 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 SCLT1Q96NL6 688 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR182O15218 404 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 VTNP04004 478 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN3P51790 818 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF174Q15697 407 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 C4orf19Q8IY42 314 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK9Q8TD19 979 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 TOP1MTQ969P6 601 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 LXNQ9BS40 222 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 PADI3Q9ULW8 664 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 PPME1Q9Y570 386 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 EVPLQ92817 2033 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR81Q562E7 1941 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 ENPP3O14638 875 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 KIZQ2M2Z5 673 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms