RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	PNOC	Q13519	176 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842		H3BRB1	525 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	MYL3	P08590	195 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	RARRES1	P49788	294 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ARMC5	Q96C12	935 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KCND2	Q9NZV8	630 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ADAMTS4	O75173	837 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PRR29	P0C7W0	189 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PLCB4	Q15147	1175 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CEP170P1	Q96L14	293 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM9	Q9C026	710 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	TRPC6	Q9Y210	931 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	MYMK	A6NI61	221 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	HBP1	O60381	514 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CYP11B2	P19099	503 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PADI6	Q6TGC4	694 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	RNF180	Q86T96	592 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PPME1	Q9Y570	386 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KAT6A	Q92794	2004 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM150B	A6NC51	233 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	MYADML2	A6NDP7	307 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	F2	P00734	622 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	DPYD	Q12882	1025 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CUL4B	Q13620	913 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	DDX12P	Q92771	950 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	SMARCE1	Q969G3	411 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	NPEPPS	P55786	919 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ASIC1	P78348	528 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	MTERF2	Q49AM1	385 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	LHX8	Q68G74	356 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	CENPF	P49454	3210 aa		31.7	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	CCL5	P13501	91 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	CASP1	P29466	404 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	ARSH	Q5FYA8	562 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MYH11	P35749	1972 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	DYM	Q7RTS9	669 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	GUCY2C	P25092	1073 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MFSD10	Q14728	455 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	GSDMA	Q96QA5	445 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RNF208	Q9H0X6	261 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	COL1A2	P08123	1366 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	SYCE3	A1L190	88 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	DGAT1	O75907	488 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RFC5	P40937	340 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	PSEN2	P49810	448 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MTFR1	Q15390	333 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	KCNA10	Q16322	511 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	SPATA20	Q8TB22	786 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	KAT2B	Q92831	832 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	RMND1	Q9NWS8	449 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC41	Q15345	812 aa		31.66	■■■□□ 2.66

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