RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LY75	O60449	1722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LMAN1	P49257	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PAK1	Q13153	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MTR	Q99707	1265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	APBA2	Q99767	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPN18	Q99952	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	VTN	P04004	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MAP2K2	P36507	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARPP19	P56211	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PSMC6	P62333	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UBXN1	Q04323	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	INHA	P05111	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MYB	P10242	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EVC	P57679	992 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ADAM9	Q13443	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MAFG	O15525	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HIP1R	O75146	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MED24	O75448	989 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KRT5	P13647	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	INSRR	P14616	1297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CD19	P15391	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ITGB5	P18084	799 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KLRC1	P26715	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MAPK6	Q16659	721 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	COL4A1	P02462	1669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A1W2PQ27	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A1W2PQ64	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A1W2PQD8	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms