RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 MMP19Q99542 508 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SFI1A8K8P3 1242 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 COASYQ13057 564 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DONSONQ9NYP3 566 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 E9PMD0 336 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SCYL1Q96KG9 808 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WWV3 80 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 TTC39CQ8N584 583 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CCNYQ8ND76 341 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 TMEM260Q9NX78 707 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 NYAP2Q9P242 653 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 EPHA7Q15375 998 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 STYK1Q6J9G0 422 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 USP32Q8NFA0 1604 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 C19orf81C9J6K1 198 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MOCS3O95396 460 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PDE1BQ01064 536 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TKFCQ3LXA3 575 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LDHDQ86WU2 507 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SLC26A4O43511 780 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CHRNA5P30532 468 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ELF1P32519 619 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TMEM35BQ8NCS4 154 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 OTUD5Q96G74 571 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CALN1Q9BXU9 219 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 FLT1P17948 1338 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 POTEB3A0JP26 581 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 POTECB2RU33 542 aa18.36■□□□□ 0.53
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NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TTC1Q99614 292 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ATP1A3P13637 1013 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CIITAP33076 1130 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TIPINQ9BVW5 301 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ACTN1P12814 892 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RWDD2BP57060 319 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LRRD1A4D1F6 860 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.533e-11■■■□□ 17.9
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NISCH-213ENST00000489895 CPP00450 1065 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 KYAT1Q16773 422 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CPS1P31327 1500 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ECE1P42892 770 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ZNF543Q08ER8 600 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 COG2Q14746 738 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 BEST2Q8NFU1 509 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DENND3A2RUS2 1198 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GSTA1P08263 222 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GSTA2P09210 222 aa18.34■□□□□ 0.53
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