RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 APOBRQ0VD83 1088 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 HYAL1Q12794 435 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 CAMK1Q14012 370 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 PKN1Q16512 942 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 ODR4Q5SWX8 454 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZUG5 572 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXL16Q8N461 479 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4-210ENST00000489601 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAMTS3O15072 1205 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS6KA5O75582 802 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ALADP13716 330 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CPA1P15085 419 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP4AP20648 1035 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GNA11P29992 359 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM86C2PA6NEL3 165 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ITGB1P05556 798 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPA4P34932 840 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ZP2Q05996 745 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 BRF1Q92994 677 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RGS18Q9NS28 235 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 C5orf42Q9H799 3197 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PRR33A8MZF0 331 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR182O15218 404 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAJB1P25685 340 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CIITAP33076 1130 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAM15Q13444 863 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GINS2Q9Y248 185 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 MBTPS2O43462 519 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 MGEA5O60502 916 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 C22orf31O95567 290 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PSAPP07602 524 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GATMP50440 423 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 NTRK3Q16288 839 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 BICD2Q8TD16 824 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 POF1BQ8WVV4 589 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 UIMC1Q96RL1 719 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAM2Q99965 735 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 IGFLR1Q9H665 355 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 C9IYK1 514 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 TBX10O75333 385 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS6KB1P23443 525 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PRR16Q569H4 304 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 PHKBQ93100 1093 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 DENND3A2RUS2 1198 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 MAGEB2O15479 319 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC01565O15544 149 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 DCXO43602 365 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR32O75388 356 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 CSPG5O95196 566 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 IRS1P35568 1242 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM189BP81408 668 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE3AQ05086 875 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 KIZQ2M2Z5 673 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM228AQ86W67 206 aa18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms