RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486610.1

ATAD2B-208, Transcript of ATPase family, AAA domain containing 2B, human

TSL 3

Gene ATAD2B, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATAD2B-208	ENST00000486610	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATAD2B-208	ENST00000486610	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATAD2B-208	ENST00000486610	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATAD2B-208	ENST00000486610	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATAD2B-208	ENST00000486610	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATAD2B-208	ENST00000486610	ITGB1	P05556	798 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	EPHA5	P54756	1037 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	IL13RA1	P78552	427 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	PAK2	Q13177	524 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SV2C	Q496J9	727 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	MSC	O60682	206 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	CASP7	P55210	303 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GFRA1	P56159	465 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	MYADML2	A6NDP7	307 aa		5	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	NCAPH	Q15003	741 aa		5	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610		Q9UFV3	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	NR4A1	P22736	598 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	STAT3	P40763	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	CD83	Q01151	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	MAPK7	Q13164	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SHD	Q96IW2	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	PTGS1	P23219	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GRK2	P25098	689 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GRK3	P35626	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	STAT5B	P51692	787 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	TAP1	Q03518	808 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ACAP1	Q15027	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	NELL1	Q92832	810 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	MNT	Q99583	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATAD2B-208	ENST00000486610	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	USP14	P54578	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	STIL	Q15468	1287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	PTH2R	P49190	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	RABGGTB	P53611	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	ADAM15	Q13444	863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	MOGS	Q13724	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	ECE1	P42892	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	PRR16	Q569H4	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATAD2B-208	ENST00000486610		Q6YL49	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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