RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 METTL13Q8N6R0 699 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PLVAPQ9BX97 442 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 FAM50BQ9Y247 325 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 DENND3A2RUS2 1198 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 GPR182O15218 404 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NCK2O43639 380 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 COL9A1P20849 921 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CIITAP33076 1130 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NTRK3Q16288 839 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 FAM167AQ96KS9 214 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 WDR64B1ANS9 1081 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 USP11P51784 963 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 EVCP57679 992 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CLDND1Q9NY35 253 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 REV3LO60673 3130 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 MAGEB2O15479 319 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 GAS7O60861 476 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TMOD1P28289 359 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 WDR81Q562E7 1941 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS3O15072 1205 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 GRM6O15303 877 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CSPG5O95196 566 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 DEXIO95424 95 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ATP4AP20648 1035 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 P2RX5Q93086 422 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 MAP7D2Q96T17 732 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 DISC1Q9NRI5 854 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CHMP2AO43633 222 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 C22orf31O95567 290 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 SFNP31947 248 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 RIT2Q99578 217 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 OSMRQ99650 979 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ADAM2Q99965 735 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TMX1Q9H3N1 280 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 AAASQ9NRG9 546 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 AKT3Q9Y243 479 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 MMP1P03956 469 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 VTNP04004 478 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 JAK3P52333 1124 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 STK3Q13188 491 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 KIZQ2M2Z5 673 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 NEK9Q8TD19 979 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TBCKQ8TEA7 893 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 MSH4O15457 936 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 OATP04181 439 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 IL9P15248 144 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 GALNT17Q6IS24 598 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 BLIDQ8IZY5 108 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SCLT1Q96NL6 688 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 IGFLR1Q9H665 355 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 RGS18Q9NS28 235 aa22.75■■□□□ 1.23
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