RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 NKX3-2P78367 333 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL6Q8N841 843 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 BDH2Q9BUT1 245 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 GPR27Q9NS67 375 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ITSN1Q15811 1721 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 DCCP43146 1447 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP12Q02952 1782 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KRIT1O00522 736 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ANP32CO43423 234 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 MAFKO60675 156 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TOM1O60784 492 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CAPNS1P04632 268 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ITGA1P56199 1179 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 EMC4Q5J8M3 183 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 UBXN11Q5T124 520 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 MORC1Q86VD1 984 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 DTLQ9NZJ0 730 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 MYOTQ9UBF9 498 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 USP6P35125 1406 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 MSCO60682 206 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 FGFR1P11362 822 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 RTP5Q14D33 572 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC184Q52MB2 194 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 FERMT3Q86UX7 667 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF4Q8WV16 495 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 JAM3Q9BX67 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 GRK2P25098 689 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CNR2P34972 360 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 GRK3P35626 688 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NFKB2Q00653 900 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PLP2Q04941 152 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 CR1LQ2VPA4 569 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NSMFQ6X4W1 530 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 COG3Q96JB2 828 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 USP35Q9P2H5 1018 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SSH2Q76I76 1423 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 BLACEA4D250 179 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NOBOXO60393 691 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TADA3O75528 432 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2B1P20020 1258 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KIZQ2M2Z5 673 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 LNPKQ9C0E8 428 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KIF1AQ12756 1690 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 SLC27A2O14975 620 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PDPK1O15530 556 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 GNAT1P11488 350 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R1AP30153 589 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-2P60368 255 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM9Q13443 819 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 NTRK3Q16288 839 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MTERF2Q49AM1 385 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 MCTP2Q6DN12 878 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TEPPQ6URK8 271 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 LBX2Q6XYB7 198 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 OSBP2Q969R2 916 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CLIC6Q96NY7 704 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.27□□□□□ -1.41
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