RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB2P25686 324 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 IKBKEQ14164 716 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 LPIN1Q14693 890 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 IER5Q5VY09 327 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 DEFB123Q8N688 67 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 SEPT8Q92599 483 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 CEP89Q96ST8 783 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A7Q96T83 725 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TMEM150BA6NC51 233 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 H3BQV1 296 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 GHRP10912 638 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 NBR1Q14596 966 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 DYDC2Q96IM9 177 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 RGL1Q9NZL6 768 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB14O75071 495 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ6P48051 423 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 RABGGTBP53611 331 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 DEFB103AP81534 67 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MCTP1Q6DN14 999 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ANO5Q75V66 913 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 METTL13Q8N6R0 699 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LXNQ9BS40 222 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 M0QZ92 97 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SLITRK3O94933 977 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 RAB30Q15771 203 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MTERF2Q49AM1 385 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 C4orf19Q8IY42 314 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 APBB2Q92870 758 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SNX21Q969T3 373 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TIFAQ96CG3 184 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MSRAQ9UJ68 235 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SQORQ9Y6N5 450 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 OR52Z1P0C646 297 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CLCN3P51790 818 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CYP4A11Q02928 519 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.352e-30■■■□□ 14.8
ACTB-211ENST00000480301 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SIP14410 1827 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MYOGP15173 224 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TPH2Q8IWU9 490 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 FAM161BQ96MY7 647 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 EVPLQ92817 2033 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 POTEMA6NI47 508 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB39O15060 712 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 GPR32O75388 356 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 VTNP04004 478 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CD52P31358 61 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TECP42680 631 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 NPEPPSP55786 919 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 USP38Q8NB14 1042 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LYPLA2O95372 231 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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