RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NPNTQ6UXI9 565 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT78Q8N1N4 520 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf31Q8N865 590 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-209ENST00000473406 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN8A6NHC0 703 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 KRIT1O00522 736 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR1BP28222 390 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHAP31040 664 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CCT5P48643 541 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ELF2Q15723 593 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MUM1Q2TAK8 710 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 BEND4Q6ZU67 534 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2C3Q8N628 320 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 WHAMMQ8TF30 809 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CCT6BQ92526 530 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 GATA6Q92908 595 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BS24 57 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MGEA5O60502 916 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH2P05091 517 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LPLP06858 475 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 GJA4P35212 333 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD1Q719H9 257 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP9Q86TI2 863 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA5Q8NB90 893 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 FERMT2Q96AC1 680 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 POFUT1Q9H488 388 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SCINQ9Y6U3 715 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXP2O15409 715 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 FUCA1P04066 466 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SRGNP10124 158 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CHKAP35790 457 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PRIM2P49643 509 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP4Q13115 394 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MROH9Q5TGP6 573 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC174Q6PII3 467 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ZAR1Q86SH2 424 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2FQ969M7 185 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CGRRF1Q99675 332 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS38A1L453 326 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf172C9J069 976 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms