RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 PHKBQ93100 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.86■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 PRR16Q569H4 304 aa21.85■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.84■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 METTL13Q8N6R0 699 aa21.84■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.84■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 DENND3A2RUS2 1198 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.83■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-206ENST00000471526 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.83■■□□□ 1.09
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SHQ1-206ENST00000471526 ALADP13716 330 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 PSMA5P28066 241 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 IRS1P35568 1242 aa21.81■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.81■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.8■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 MYO7AQ13402 2215 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 NID2Q14112 1375 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 C9IYK1 514 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 MBTPS2O43462 519 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 TBX10O75333 385 aa21.79■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 IFNAR1P17181 557 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 NDUFV1P49821 464 aa21.79■■□□□ 1.08
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