RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.65■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 SQORQ9Y6N5 450 aa24.65■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 COL4A6Q14031 1691 aa24.65■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 WDR64B1ANS9 1081 aa24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 MSH4O15457 936 aa24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 AIFM3Q96NN9 605 aa24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC28-204ENST00000468807 H3BNC9 293 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 GAS7O60861 476 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 USP11P51784 963 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 BLIDQ8IZY5 108 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 WDR81Q562E7 1941 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 GJA10Q969M2 543 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 DISC1Q9NRI5 854 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 EDIL3O43854 480 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 RPS6KA5O75582 802 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 CSPG5O95196 566 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 C22orf31O95567 290 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 KIZQ2M2Z5 673 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 FAM167AQ96KS9 214 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 DGKIO75912 1065 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 CDKL5O76039 1030 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TDP2O95551 362 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 VTNP04004 478 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 STAG3L1P0CL83 205 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 SCRN1Q12765 414 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 BANK1Q8NDB2 785 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 RIT2Q99578 217 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 OSMRQ99650 979 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TMX1Q9H3N1 280 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 DENND3A2RUS2 1198 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 DTNBO60941 627 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 OATP04181 439 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 KCNA5P22460 613 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 BMPR1AP36894 532 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 CLCN3P51790 818 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 PRKCEQ02156 737 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 SLC5A5Q92911 643 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 AKT3Q9Y243 479 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 MYO7AQ13402 2215 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 SFNP31947 248 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 JAK3P52333 1124 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 UGCGQ16739 394 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 Q4G0T1 1027 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 GALNT17Q6IS24 598 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-204ENST00000468807 GPR182O15218 404 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 MAGEB2O15479 319 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 RB1P06400 928 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 ODR4Q5SWX8 454 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 MAP7D2Q96T17 732 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 M0R2N6 131 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 GRM6O15303 877 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 ZNF862O60290 1169 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 MGEA5O60502 916 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 LINC00271P0C7V0 271 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 XBP1P17861 261 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 TMOD1P28289 359 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-204ENST00000468807 NPY5RQ15761 445 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms