RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TMEM150B	A6NC51	233 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	POTEM	A6NI47	508 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB2	O15479	319 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CHRNA1	P02708	482 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SYT1	P21579	422 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PTGDR	Q13258	359 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MBTPS1	Q14703	1052 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	GPNMB	Q14956	572 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	RPAIN	Q86UA6	219 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	VWCE	Q96DN2	955 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	LXN	Q9BS40	222 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		19.9	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	C22orf31	O95567	290 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SI	P14410	1827 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	GINS2	Q9Y248	185 aa		19.89	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CXCL10	P02778	98 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	GHR	P10912	638 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TMOD1	P28289	359 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	IKBKE	Q14164	716 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	FAM26D	Q5JW98	314 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	RASIP1	Q5U651	963 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	BRAP	Q7Z569	592 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	NME8	Q8N427	588 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	GUCD1	Q96NT3	240 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	AKT3	Q9Y243	479 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	GBF1	Q92538	1859 aa		19.88	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SLITRK3	O94933	977 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	STBD1	O95210	358 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ6	P48051	423 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CLCN3	P51790	818 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ANO5	Q75V66	913 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	C4orf19	Q8IY42	314 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ERMN	Q8TAM6	284 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	NEK9	Q8TD19	979 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SEPT8	Q92599	483 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CEP170P1	Q96L14	293 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	MAP7D2	Q96T17	732 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		19.87	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	BAIAP3	O94812	1187 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	VTN	P04004	478 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	NPEPPS	P55786	919 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	MGAT3	Q09327	533 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	XKR9	Q5GH70	373 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	FAM161B	Q96MY7	647 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	RAB34	Q9BZG1	259 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ARID2	Q68CP9	1835 aa		19.86	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	LAD1	O00515	517 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	STX6	O43752	255 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	DNM2	P50570	870 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	TCTN1	Q2MV58	587 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	SCLT1	Q96NL6	688 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		19.85	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB39	O15060	712 aa		19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
USP19-210	ENST00000465902	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	19.84	■□□□□ 0.77	3e-9	■■■■■ 34.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms