RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 OATP04181 439 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 TMOD1P28289 359 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 CD52P31358 61 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 INF2Q27J81 1249 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF862O60290 1169 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 SEC24BO95487 1268 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PAK2Q13177 524 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 IL27Q8NEV9 243 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PPM1EQ8WY54 764 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 UIMC1Q96RL1 719 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 GPR182O15218 404 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 UPP2O95045 317 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CDC42EP1Q00587 391 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LETM2Q2VYF4 491 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 XKR3Q5GH77 459 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 COG5Q9UP83 839 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 RB1P06400 928 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 STAG3L1P0CL83 205 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 KRT2P35908 639 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PRKCEQ02156 737 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PPP2R5CQ13362 524 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 NECAB1Q8N987 351 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 RPS6KA5O75582 802 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 AAK1Q2M2I8 961 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 EPC2Q52LR7 807 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 SPRED2Q7Z698 418 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 FIBCD1Q8N539 461 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 METTL13Q8N6R0 699 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 ASB2Q96Q27 587 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 MAP7D2Q96T17 732 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 EYSQ5T1H1 3165 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 H3BNC9 293 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CHMP2AO43633 222 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 GPR32O75388 356 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 DGKIO75912 1065 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LARGE1O95461 756 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PTPROQ16827 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM192Q8IY95 271 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TNFRSF25Q93038 417 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PPME1Q9Y570 386 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 SLC37A4O43826 429 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 PSMC5P62195 406 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM29Q14134 588 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 OXER1Q8TDS5 423 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 GBF1Q92538 1859 aa23.45■■□□□ 1.35
SIKE1-204ENST00000462123 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 MMP1P03956 469 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 UGCGQ16739 394 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 C8orf34Q49A92 452 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 TMX1Q9H3N1 280 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-204ENST00000462123 RGS18Q9NS28 235 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms