RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SNPHO15079 494 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 HBP1O60381 514 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RSPH10BP0C881 870 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB2P25686 324 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRC1P26715 233 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RFC2P35250 354 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RPAINQ86UA6 219 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RIT2Q99578 217 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 DISC1Q9NRI5 854 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 COL4A6Q14031 1691 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO7AQ13402 2215 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WWV3 80 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LCHNA4D1U4 455 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBBXA8MT70 800 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR64B1ANS9 1081 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS7O60861 476 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PSAPP07602 524 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GHRP10912 638 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GNAT1P11488 350 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 XBP1P17861 261 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP2B1P20020 1258 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT76Q01546 638 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 DRP2Q13474 957 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LPIN1Q14693 890 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIN2CQ14957 1233 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR153Q6NV75 609 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 BANK1Q8NDB2 785 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 WASF1Q92558 559 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf76Q96K31 380 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MTMR9Q96QG7 549 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 AZI2Q9H6S1 392 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RGL1Q9NZL6 768 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TRANK1O15050 2925 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIP11Q15643 1979 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 EPOPA6NHQ4 379 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 RFXAPO00287 272 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR32O75388 356 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 C22orf31O95567 290 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PFKMP08237 780 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 GJB2P29033 226 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCN3P51790 818 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKCEQ02156 737 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R5CQ13362 524 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF174Q15697 407 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 MYLIPQ8WY64 445 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TIFAQ96CG3 184 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 DYDC2Q96IM9 177 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-206ENST00000461017 TMX1Q9H3N1 280 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms