RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEIS3Q99687 375 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH19Q9H159 772 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF181Q9P0P0 153 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB6AP20340 208 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP7A1P22680 504 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTD1Q8N815 330 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH3P11055 1940 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHD4Q14839 1912 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNED1Q8TER0 1413 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BBOX1O75936 387 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYGMP11217 842 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELNP15502 786 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPSM2P81274 684 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUCY1A3Q02108 690 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4F3Q08477 520 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP9Q49MG5 647 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMC5Q8IY18 1101 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOOK2Q96ED9 719 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF112Q9ULX5 631 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL4A5P29400 1685 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SBF1O95248 1867 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAP23O00161 211 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLEC6O43699 453 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSF1RP07333 972 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP11P51784 963 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POU4F1Q01851 419 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE4AQ14139 1066 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZNB5 142 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SP8Q8IXZ3 490 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRF7Q92985 503 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM11Q96F44 468 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UTYO14607 1347 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8W735 103 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE2BO14633 110 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABRDO14764 452 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ID4P47928 161 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PREPP48147 710 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCRN1Q12765 414 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BIRC2Q13490 618 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AOC3Q16853 763 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXNQ6DKJ4 435 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COG1Q8WTW3 980 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEMA6CQ9H3T2 930 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRAGCQ9HB90 399 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms