RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 EP400Q96L91 3159 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 44.4
SH3BP1-203ENST00000451997 PPP1R2P41236 205 aa13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 IQCDQ96DY2 449 aa13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 ANP32DO95626 131 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 AGAP11Q8TF27 550 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L11C9JVI0 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L18D6R9N7 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L22D6RA61 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L19D6RCP7 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L20D6RJB6 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 H2AFZP0C0S5 128 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 PLA2G4BP0C869 781 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 USP17L24Q0WX57 530 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 34
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SH3BP1-203ENST00000451997 H2AFVQ71UI9 128 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.72□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
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SH3BP1-203ENST00000451997 FAM167BQ9BTA0 163 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 GGA2Q9UJY4 613 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 CETN3O15182 167 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 LRRN2O75325 713 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 PLCG2P16885 1265 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 RFC4P35249 363 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-203ENST00000451997 KCNJ1P48048 391 aa13.71□□□□□ -0.21
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