RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440048.1

VARS-217, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VARS, Length 804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-217ENST00000440048 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 LPIN1Q14693 890 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 NME8Q8N427 588 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 CDH23Q9H251 3354 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 CALCRLQ16602 461 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 BANK1Q8NDB2 785 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 ZNF576Q9H609 170 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 M0QZ92 97 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 NEMFO60524 1076 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 STBD1O95210 358 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 ATP2B1P20020 1258 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 KIF3AQ9Y496 699 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-217ENST00000440048 KIF28PB7ZC32 967 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MAGEB2O15479 319 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 PSMC5P62195 406 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 XKR3Q5GH77 459 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 METTL13Q8N6R0 699 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 APBB2Q92870 758 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 EPHA7Q15375 998 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MTMR9Q96QG7 549 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TMEM150BA6NC51 233 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 GJB2P29033 226 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MCM7P33993 719 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 GRIN2CQ14957 1233 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SQORQ9Y6N5 450 aa26.55■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 AMHP03971 560 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.844e-14■■□□□ 11.8
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VARS-217ENST00000440048 CLCN3P51790 818 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MTERF2Q49AM1 385 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TLL1O43897 1013 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 GJB5O95377 273 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 CA3P07451 260 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 CD52P31358 61 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 ZNF174Q15697 407 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 USP38Q8NB14 1042 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 MYLIPQ8WY64 445 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 CEP89Q96ST8 783 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 CDHR5Q9HBB8 845 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 GINS2Q9Y248 185 aa26.53■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 VTNP04004 478 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TTC38Q5R3I4 469 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 ANO5Q75V66 913 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 DYDC2Q96IM9 177 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 RGL1Q9NZL6 768 aa26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
VARS-217ENST00000440048 TMOD1P28289 359 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 TRAPPC10P48553 1259 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 KIZQ2M2Z5 673 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 MAP7D2Q96T17 732 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 LXNQ9BS40 222 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-217ENST00000440048 PADI3Q9ULW8 664 aa26.51■■□□□ 1.83
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