RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439822.6

PLEKHB2-208, Transcript of pleckstrin homology domain containing B2, human

TSL 3 BASIC

Gene PLEKHB2, Length 4,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP14	P54578	494 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	IGBP1	P78318	339 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	C8orf74	Q6P047	294 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RNF181	Q9P0P0	153 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KCNJ6	P48051	423 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MYL7	Q01449	175 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	C4A	P0C0L4	1744 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LRP5	O75197	1615 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	AKAP3	O75969	853 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLITRK3	O94933	977 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PEX26	Q7Z412	305 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GAP43	P17677	238 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ANKRD7	Q92527	254 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	STK24	Q9Y6E0	443 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PALM	O75781	387 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GUCY2F	P51841	1108 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OSTN	P61366	133 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HERVK_113	P62684	666 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RPS6KA1	Q15418	735 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARSH	Q5FYA8	562 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MIIP	Q5JXC2	388 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CEP63	Q96MT8	703 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PSMD1	Q99460	953 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SERPING1	P05155	500 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ICAM1	P05362	532 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NR3C2	P08235	984 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EPHA7	Q15375	998 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	WDR59	Q6PJI9	974 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ELP3	Q9H9T3	547 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CEP72	Q9P209	647 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RCCD1	A6NED2	376 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TBX3	O15119	743 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LIG4	P49917	911 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	STRN3	Q13033	797 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MRI	Q9BWK5	157 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLC12A3	P55017	1021 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HDX	Q7Z353	690 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms