RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429976.5

TRANK1-201, Transcript of tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TRANK1, Length 10,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRANK1-201ENST00000429976 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa10.65□□□□□ -0.7
TRANK1-201ENST00000429976 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRANK1-201ENST00000429976 PTPREP23469 700 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 DACH2Q96NX9 599 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 GYG2O15488 501 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CENPUQ71F23 418 aa10.65□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NEDD4P46934 1319 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 GFAPP14136 432 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ATP6V0A1Q93050 837 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MXI1P50539 228 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 LRRC14Q15048 493 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 RASA4BC9J798 803 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 RASA4O43374 803 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ERFEQ4G0M1 354 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SERPINI1Q99574 410 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 BCS1LQ9Y276 419 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ATP10DQ9P241 1426 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 LRRC53A6NM62 1247 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 OCM2P0CE71 109 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 KCNQ4P56696 695 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 STAP2Q9UGK3 403 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MED7O43513 233 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 UBE3CQ15386 1083 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ANO4Q32M45 955 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PIGOQ8TEQ8 1089 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 OSBP2Q969R2 916 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ADD2P35612 726 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MAGEA9P43362 315 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 GGT7Q9UJ14 662 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ZNF711Q9Y462 761 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.64□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CREB3O43889 395 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 AK8Q96MA6 479 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 TRIM15Q9C019 465 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 COPEO14579 308 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 KLC3Q6P597 504 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ARL8AQ96BM9 186 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 APBA3O96018 575 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ARHGDIAP52565 204 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SYNMO15061 1565 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 RWDD2BP57060 319 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NUP85Q9BW27 656 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 EPHB1P54762 984 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NRBF2Q96F24 287 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PARVGQ9HBI0 331 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 KCNA1Q09470 495 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 TNFAIP1Q13829 316 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 TRIM60Q495X7 471 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 NLRP14Q86W24 1093 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 DCTN3O75935 186 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 CCNE1P24864 410 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 SPARCL1Q14515 664 aa10.63□□□□□ -0.71
TRANK1-201ENST00000429976 HIF1AQ16665 826 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms