RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNJ18B7U540 433 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGS20O76081 388 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSMD2Q13200 908 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRF5Q13568 498 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNJ12Q14500 433 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MORN1Q5T089 497 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEPT14Q6ZU15 432 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARMCX2Q7L311 632 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BANK1Q8NDB2 785 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM47Q96LD4 638 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APBA2Q99767 749 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLD4Q9HCU8 107 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IMPACTQ9P2X3 320 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASTN1O14525 1302 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.91□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR64B1ANS9 1081 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXC6P09630 235 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSPH10BP0C881 870 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXD10P28358 340 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLCN1P35523 988 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R2P41236 205 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SP3Q02447 781 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA8FQ08AF8 430 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTLL4Q14679 1199 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CENPPQ6IPU0 288 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC8AQ8IWT6 810 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCFD2Q8WU76 684 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAML3Q96JK9 1138 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 REEP2Q9BRK0 252 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LXNQ9BS40 222 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 THAP9Q9H5L6 903 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MGAMO43451 1857 aa10.9□□□□□ -0.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BICDL2A1A5D9 508 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCNE2O96020 404 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNRH1P01148 92 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSAPP07602 524 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PBX1P40424 430 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSMC4P43686 418 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GSDMDP57764 484 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCZ1BP86790 482 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SFR1Q86XK3 245 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FGD4Q96M96 766 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NACC1Q96RE7 527 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TINF2Q9BSI4 451 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VPS16Q9H269 839 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF186Q9NXI6 227 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYH11P35749 1972 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPA1O75762 1119 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D8O95759 1140 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNA2P16389 499 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSPA6P17066 643 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPAG1Q07617 926 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UGCGQ16739 394 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CREBRFQ8IUR6 639 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms