RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 HSCBQ8IWL3 235 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 NME8Q8N427 588 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 METTL13Q8N6R0 699 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 KAT6AQ92794 2004 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 DYDC2Q96IM9 177 aa20.23■□□□□ 0.83
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HERC3-205ENST00000426683 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 POTEMA6NI47 508 aa20.21■□□□□ 0.83
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HERC3-205ENST00000426683 KCNJ6P48051 423 aa20.21■□□□□ 0.83
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HERC3-205ENST00000426683 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.21■□□□□ 0.83
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HERC3-205ENST00000426683 NEK9Q8TD19 979 aa20.2■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 APBB2Q92870 758 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 MAP7D2Q96T17 732 aa20.19■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 SYT1P21579 422 aa20.18■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 NPEPPSP55786 919 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 DEFB103AP81534 67 aa20.18■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 CEP170P1Q96L14 293 aa20.18■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 ZBTB39O15060 712 aa20.17■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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HERC3-205ENST00000426683 FERMT3Q86UX7 667 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 DEFB123Q8N688 67 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 USP38Q8NB14 1042 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 TIFAQ96CG3 184 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 MSRAQ9UJ68 235 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 WDR81Q562E7 1941 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 LAD1O00515 517 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 LYPLA2O95372 231 aa20.16■□□□□ 0.82
HERC3-205ENST00000426683 CD52P31358 61 aa20.16■□□□□ 0.82
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