RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GINS2Q9Y248 185 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO9BQ13459 2157 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BQV1 296 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 XKR3Q5GH77 459 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ODR4Q5SWX8 454 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BANK1Q8NDB2 785 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMC3Q9UQE7 1217 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF862O60290 1169 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MCM7P33993 719 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TXKP42681 527 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNM2P50570 870 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB103AP81534 67 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MGAT3Q09327 533 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAK2Q13177 524 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EPHA7Q15375 998 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UGCGQ16739 394 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MTERF2Q49AM1 385 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MCTP1Q6DN14 999 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GBF1Q92538 1859 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HAS1Q92839 578 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VAV3Q9UKW4 847 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKT3Q9Y243 479 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SQORQ9Y6N5 450 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EML1O00423 815 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C22orf31O95567 290 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CA3P07451 260 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYOGP15173 224 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOSL2P15408 326 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GJB2P29033 226 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LPIN1Q14693 890 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OTUD6AQ7L8S5 288 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCLT1Q96NL6 688 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GUCD1Q96NT3 240 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAD9AQ99638 391 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS6KA5O75582 802 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UPP2O95045 317 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GJB5O95377 273 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD52P31358 61 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAPPC10P48553 1259 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRIN2CQ14957 1233 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF174Q15697 407 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCTN1Q2MV58 587 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC38Q5R3I4 469 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TPH2Q8IWU9 490 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NEK9Q8TD19 979 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYLIPQ8WY64 445 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 INSL6Q9Y581 213 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR182O15218 404 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VTNP04004 478 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLCN3P51790 818 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC42EP1Q00587 391 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP4A11Q02928 519 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIZQ2M2Z5 673 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERMNQ8TAM6 284 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC7A3Q8WY07 619 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms