RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 RDM1Q8NG50 284 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 GJA10Q969M2 543 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 MAGEB2O15479 319 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PSMD10O75832 226 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 LARGE1O95461 756 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 OATP04181 439 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 ODR4Q5SWX8 454 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 MBOAT7Q96N66 472 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PADI3Q9ULW8 664 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.11■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 C22orf31O95567 290 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 TMOD1P28289 359 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KRT2P35908 639 aa22.11■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 OXER1Q8TDS5 423 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 SAMD11Q96NU1 681 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 THEGQ9P2T0 379 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 WDR81Q562E7 1941 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 EVPLQ92817 2033 aa22.11■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.1■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM20AQ96MK3 541 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 MAP7D2Q96T17 732 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF862O60290 1169 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 RPS6KA5O75582 802 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 UGCGQ16739 394 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KRT40Q6A162 431 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 FIBCD1Q8N539 461 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.09■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 SLC37A4O43826 429 aa22.08■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 STAG3L1P0CL83 205 aa22.08■■□□□ 1.13
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ANKRD54-204ENST00000411961 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KIZQ2M2Z5 673 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 IL27Q8NEV9 243 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-204ENST00000411961 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 GPR182O15218 404 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 LPXNO60711 386 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 CLCN3P51790 818 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NR5A1Q13285 461 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 EPC2Q52LR7 807 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 XKR3Q5GH77 459 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 DENND3A2RUS2 1198 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 JAK2O60674 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 TMEM192Q8IY95 271 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 BANK1Q8NDB2 785 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 SCLT1Q96NL6 688 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 OSMRQ99650 979 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 CDH23Q9H251 3354 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 TBX3O15119 743 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 MMP1P03956 469 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 PSMC5P62195 406 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 GPM6BQ13491 265 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-204ENST00000411961 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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