RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 B4E1Z4 1266 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GFRA2O00451 464 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MEIS1O00470 390 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 LATS1O95835 1130 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPD1P21695 349 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CERS1P27544 350 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ETV4P43268 484 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHMP4BP1P59074 171 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP12-4P60329 112 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCY1B3Q02153 619 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIN1Q13671 783 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC6Q16204 474 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QL3Q5VWW1 255 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM198BQ6UWH4 519 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMC5Q6UXY8 1006 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKMY2Q8IV38 441 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLFN12Q8IYM2 578 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRACQ8N912 160 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGBD4Q96DM1 585 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTCHD1Q96NR3 888 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMP4Q99727 224 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC12A9Q9BXP2 914 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCND1Q9NSA2 647 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 AOX1Q06278 1338 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAN2B1O00754 1011 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACOT8O14734 319 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDKL5O76039 1030 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSNP06396 782 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 BMPR1AP36894 532 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP5P45974 858 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK8P49336 464 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAS1P54826 345 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP3K12Q12852 859 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRMPQ12912 555 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCM6Q14566 821 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASIP1Q5U651 963 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPINK14Q6IE38 97 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MILR1Q7Z6M3 343 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAL3ST3Q96A11 431 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC74BQ96LY2 380 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEPHQ9BQS7 1158 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZPBPQ9BS86 351 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GFRA4Q9GZZ7 299 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDCP1Q9H5V8 836 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPHS2Q9NP85 383 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 POLIQ9UNA4 740 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0B4J293 547 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PRX2 142 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE12HA6NDE8 117 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf51A8MQB3 221 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 UPK3BL2E5RIL1 263 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRG1P02750 347 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMO4P61968 165 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 HGFACQ04756 655 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDB1Q16531 1140 aa-0.13□□□□□ -2.43
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF19Q5T6S3 580 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 VASNQ6EMK4 673 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC18B1Q6NT16 456 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A7Q6PXP3 512 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAAM2Q86T65 1068 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM192Q8IY95 271 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB10Q8WXI3 467 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF31Q96EP0 1072 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 UHRF2Q96PU4 802 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 WFDC1Q9HC57 220 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL17RBQ9NRM6 502 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR13Q9NZ81 148 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 AHRRA9YTQ3 701 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L15C9J2P7 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP17L10C9JJH3 530 aa-0.14□□□□□ -2.43
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