RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405943.3

HDGFP1-201, Transcript of heparin binding growth factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene HDGFP1, Length 252 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP1-201ENST00000405943 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ABCF2Q9UG63 623 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 AMACRQ9UHK6 382 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NAGPAQ9UK23 515 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 STK24Q9Y6E0 443 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 KCPQ6ZWJ8 1503 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.9□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SMCO2A6NFE2 343 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TLR2O60603 784 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PHF2O75151 1096 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CAND2O75155 1236 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SMIM24O75264 130 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ZPR1O75312 459 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 DCTN3O75935 186 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NOL4O94818 638 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 UBOX5O94941 541 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 GJB6O95452 261 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NPTXRO95502 500 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 FGGP02679 453 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 GSTA2P09210 222 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TMEM253P0C7T8 217 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TSPY3P0CV98 308 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TSPY8P0CW00 308 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RARAP10276 462 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RARGP13631 454 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 IL2RBP14784 551 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ATP4AP20648 1035 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 MAN1A1P33908 653 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 STAT1P42224 750 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TXKP42681 527 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 BCAMP50895 628 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NCALDP61601 193 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CAV1Q03135 178 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PTK2Q05397 1052 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 STRN3Q13033 797 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NR1H3Q13133 447 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 MAPK7Q13164 816 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ACVR2BQ13705 512 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TRADDQ15628 312 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CNGA2Q16280 664 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 GALNTL6Q49A17 601 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PARP10Q53GL7 1025 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RNF43Q68DV7 783 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 DUPD1Q68J44 220 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 MFSD5Q6N075 450 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 MDM1Q8TC05 714 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 MORC4Q8TE76 937 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 RFFLQ8WZ73 363 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 INPP5DQ92835 1189 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 HES6Q96HZ4 224 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF570Q96NI8 536 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 SERPINB12Q96P63 405 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TMEM237Q96Q45 408 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CCDC77Q9BR77 488 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 AZI2Q9H6S1 392 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PFASO15067 1338 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PASKQ96RG2 1323 aa4.89□□□□□ -1.63
HDGFP1-201ENST00000405943 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms