RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 XKR3Q5GH77 459 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 SFR1Q86XK3 245 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 CEP170P1Q96L14 293 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 SFI1A8K8P3 1242 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 OATP04181 439 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 GAP43P17677 238 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 GUCY2CP25092 1073 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP1Q07960 439 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC41Q15345 812 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 GLG1Q92896 1179 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 PCYT2Q99447 389 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 STBD1O95210 358 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 MYCT1Q8N699 235 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 MED15Q96RN5 788 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 FANCLQ9NW38 375 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 HIP1RO75146 1068 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 SMPD1P17405 629 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 MTERF2Q49AM1 385 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA1Q5VX52 437 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 PARVGQ9HBI0 331 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 GABRQQ9UN88 632 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-204ENST00000402096 AP5Z1O43299 807 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ATP4AP20648 1035 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 TNFAIP2Q03169 654 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.229e-11■■□□□ 11.5
ATG4B-204ENST00000402096 LGR5O75473 907 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY5O95622 1261 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 FLT3LGP49771 235 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM50Q86XT4 487 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 P2RX5Q93086 422 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM5Q9C035 493 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 EMSYQ7Z589 1322 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CCNE1P24864 410 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 MARK3P27448 753 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 AFG1LQ8WV93 481 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 BICDL2A1A5D9 508 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 KIF20AO95235 890 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 PRKCZQ05513 592 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ODR4Q5SWX8 454 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 PPTC7Q8NI37 304 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 FAM167AQ96KS9 214 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 TIPINQ9BVW5 301 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 GCNT3O95395 438 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 IRF5Q13568 498 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 DRC1Q96MC2 740 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY6O43306 1168 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 DGAT1O75907 488 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ATP1A3P13637 1013 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF131P52739 623 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 MAPK7Q13164 816 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 DAW1Q8N136 415 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 MYBP10242 640 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG4B-204ENST00000402096 CASP5P51878 434 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms