RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MAN2B1O00754 1011 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ADCY3O60266 1144 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 AMY2AP04746 511 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 AMY2BP19961 511 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NFYCQ13952 458 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 AQP7O14520 342 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRC-204ENST00000367379 GJA4P35212 333 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 STILQ15468 1287 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NRN1LQ496H8 165 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 FIGNQ5HY92 759 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ARVCFO00192 962 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PTGS1P23219 599 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 IL13RA1P78552 427 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PTPRN2Q92932 1015 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 EXTL1Q92935 676 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 FBXW5Q969U6 566 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MSL2Q9HCI7 577 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 INCENPQ9NQS7 918 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 BTBD7Q9P203 1132 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO10Q9UK96 956 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-204ENST00000367379 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PDE6AP16499 860 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 AOAHP28039 575 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 RRADP55042 308 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 TBR1Q16650 682 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 SPATC1Q76KD6 591 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 OSTM1Q86WC4 334 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CFHR4Q92496 578 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 WNK4Q96J92 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 GALNT8Q9NY28 637 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CBLCQ9ULV8 474 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 NR2E1Q9Y466 385 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGAP6O43182 974 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 CDC14BO60729 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 FHL2Q14192 279 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-204ENST00000367379 KIF21BO75037 1637 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 MPIG6BO95866 241 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 PYGMP11217 842 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 JAM2P57087 298 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 HERVK_113P62684 666 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 PTH1RQ03431 593 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 OR14A2Q96R54 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 AKNAQ7Z591 1439 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF202O95125 648 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 HMGCRP04035 888 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 MC4RP32245 332 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 ABHD18Q0P651 414 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 HOMEZQ8IX15 550 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 AMER2Q8N7J2 671 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 FAM89AQ96GI7 184 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 BTBD2Q9BX70 525 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 AMNQ9BXJ7 453 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-204ENST00000367379 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.26□□□□□ -1.25
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