RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 RIN1Q13671 783 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 AMNQ9BXJ7 453 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 Q9UFV3 132 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ASXL2Q76L83 1435 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MAN2B1O00754 1011 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 GCP02774 474 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 OSBP2Q969R2 916 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 BTBD2Q9BX70 525 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PRODHO43272 600 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT3O95989 172 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 AMY2AP04746 511 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 AMY2BP19961 511 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 STAT5BP51692 787 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ETFBP38117 255 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MOGSQ13724 837 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 FGFR1P11362 822 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 STAT3P40763 770 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ECE1P42892 770 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 GPR19Q15760 415 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 VRK3Q8IV63 474 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PTGS2P35354 604 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 FIGNQ5HY92 759 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 RABGGTAQ92696 567 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 ALG1Q9BT22 464 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 OR10A5Q9H207 317 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MASP2O00187 686 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 TRAF5O00463 557 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 MAN2A2P49641 1150 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 C21orf58P58505 322 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-9P60411 292 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 HERVK_113P62684 666 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 HAS1Q92839 578 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 MIEF2Q96C03 454 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 SGSM3Q96HU1 749 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PRX2 142 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 WNT9AO14904 365 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 FAM20BO75063 409 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ST5P78524 1137 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ACAP1Q15027 740 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 COLEC12Q5KU26 742 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 NSMFQ6X4W1 530 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 OSTM1Q86WC4 334 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 MLST8Q9BVC4 326 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 RHOBTB3O94955 611 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 SEC23AQ15436 765 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 LENG9Q96B70 501 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CBLCQ9ULV8 474 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 XDHP47989 1333 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 JAM2P57087 298 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 PAK1Q13153 545 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM15Q13444 863 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK3O14649 394 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 PYGMP11217 842 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY7P51828 1080 aa6.73□□□□□ -1.33
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