RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363843.1

RNU6-682P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 682, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-682P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-682P-201ENST00000363843 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ZNF366Q8N895 744 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 Q9UFV3 132 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 INSL6Q9Y581 213 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MSCO60682 206 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 C1RP00736 705 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PTGS1P23219 599 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GRK2P25098 689 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GRK3P35626 688 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 STAT3P40763 770 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 STAT5BP51692 787 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 USP14P54578 494 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 EPHA5P54756 1037 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 COL4A3Q01955 1670 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 NCAPHQ15003 741 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ZNF394Q53GI3 561 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 BTBD8Q5XKL5 378 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 RABGGTAQ92696 567 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 CD244Q9BZW8 370 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 BCL11AQ9H165 835 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 INCENPQ9NQS7 918 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 NR4A1P22736 598 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 CD83Q01151 205 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MB21D1Q8N884 522 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GPR27Q9NS67 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GALNT8Q9NY28 637 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ZNF76P36508 570 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PTH2RP49190 550 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 CASP7P55210 303 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 TAP1Q03518 808 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ACAP1Q15027 740 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PRR16Q569H4 304 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 Q6YL49 198 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 C1orf159Q96HA4 380 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 WNK4Q96J92 1243 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 C16orf92Q96LL3 132 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MNTQ99583 582 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MFAP3LO75121 409 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ABCG1P45844 678 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SOX9P48436 509 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 RABGGTBP53611 331 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 ADAM15Q13444 863 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MOGSQ13724 837 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 STILQ15468 1287 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 KIZQ2M2Z5 673 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 USP53Q70EK8 1073 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 C14orf37Q86TY3 774 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 KCTD13Q8WZ19 329 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 WASF1Q92558 559 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 BTBD2Q9BX70 525 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-682P-201ENST00000363843 MC4RP32245 332 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 LCORLQ8N3X6 602 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 CAVIN3Q969G5 261 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 SHDQ96IW2 340 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-682P-201ENST00000363843 SPATA32Q96LK8 384 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms