RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PWWP2AQ96N64 755 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOX5Q96PH1 765 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 POFUT1Q9H488 388 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT8Q9NY28 637 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CROTQ9UKG9 612 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASF3Q9UPY6 502 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASHC2AQ641Q2 1341 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCHNA4D1U4 455 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOL3O95236 402 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDGFRBP09619 1106 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECE1P42892 770 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00310P59036 64 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTRA3P83110 453 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR1Q13613 665 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 STPG3Q8N7X2 389 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAML3Q96JK9 1138 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYL10Q9BUA6 226 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MENTQ9BUN1 341 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD2Q9BX70 525 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMNQ9BXJ7 453 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10A5Q9H207 317 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 VTA1Q9NP79 307 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD320Q9NPF0 282 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD3Q9Y597 815 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ESF4 209 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT1P04264 644 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHGBP05060 677 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QTNF9P0C862 333 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP1GAPP47736 663 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS3P49796 1198 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK-21P61565 698 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL13RA1P78552 427 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCY2Q08462 1091 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K12Q12852 859 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYBPC3Q14896 1274 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTP5Q14D33 572 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF385BQ569K4 471 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYDE2Q5VT97 1194 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACAP3Q96P50 834 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCND1Q9NSA2 647 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 H0Y858 1186 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAFGO15525 162 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL18BPO95998 194 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCY8P40145 1251 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAND1P57086 179 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFATC3Q12968 1075 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 STILQ15468 1287 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNA10Q16322 511 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 ODR4Q5SWX8 454 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 KANK2Q63ZY3 851 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL7Q6ZT98 887 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms