RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRLP01236 227 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGCRP04035 888 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP17A1P05093 508 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELA3BP08861 270 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETV4P43268 484 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLP2Q04941 152 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KANK2Q63ZY3 851 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 AHI1Q8N157 1196 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 E2F7Q96AV8 911 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXB1Q99853 325 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ESM1 405 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 F2P00734 622 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A1P19634 815 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD3B2P26439 372 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNQ1P51787 676 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRADP55042 308 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD83Q01151 205 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSG1Q02413 1049 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K12Q12852 859 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOGSQ13724 837 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SART3Q15020 963 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE1DQ5T752 114 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDE2Q6IQ49 451 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 NME9Q86XW9 330 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 NXPE1Q8N323 547 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTFR1LQ9H019 292 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 JADE2Q9NQC1 790 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 OXSMQ9NWU1 459 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCANO14594 1321 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JNJ9 132 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE8AO60658 829 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHB4P54760 987 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2CBP62714 309 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2CAP67775 309 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A3Q01959 620 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ROM1Q03395 351 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHA7Q15375 998 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC38Q5R3I4 469 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf92Q96LL3 132 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOMM22Q9NS69 142 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFT57Q9NWB7 429 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q9UFV3 132 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRG2O14669 202 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGSF3O75054 1194 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB3P05106 788 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS3P49796 1198 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCNN1BP51168 640 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GYS2P54840 703 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 OCRLQ01968 901 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLFN13Q68D06 897 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFHBQ8N7U6 833 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 C7orf31Q8N865 590 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAML3Q96JK9 1138 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCYL1Q96KG9 808 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms