RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB123Q8N688 67 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 FAM161BQ96MY7 647 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 CEP89Q96ST8 783 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R16BQ96T49 567 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 NRBP2Q9NSY0 501 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 CEP131Q9UPN4 1083 aa30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 MYOGP15173 224 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 CLCN3P51790 818 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 MTERF2Q49AM1 385 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 XKR3Q5GH77 459 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO47Q5MNV8 452 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G4FQ68DD2 849 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 ANO5Q75V66 913 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC71Q8N4P6 559 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01465Q8N7H1 131 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 DYDC2Q96IM9 177 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA12Q9UN75 941 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TRPV2Q9Y5S1 764 aa30.31■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 POTEMA6NI47 508 aa30.3■■■□□ 2.44
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TPGS1-201ENST00000359315 CYP4A11Q02928 519 aa30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LXNQ9BS40 222 aa30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 CDHR5Q9HBB8 845 aa30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa30.3■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 H3BQV1 296 aa30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 P4HBP07237 508 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC10P48553 1259 aa30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 METTL13Q8N6R0 699 aa30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 SEPT8Q92599 483 aa30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 SIP14410 1827 aa30.29■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 VTNP04004 478 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 OR52Z1P0C646 297 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 IKBKEQ14164 716 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 IER5Q5VY09 327 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf32Q8N8J7 132 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TIFAQ96CG3 184 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 SLC9A7Q96T83 725 aa30.28■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
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TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB39O15060 712 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ6P48051 423 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 NPEPPSP55786 919 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 DRP2Q13474 957 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF697Q5TEC3 545 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB12Q6NXP0 572 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 HERC6Q8IVU3 1022 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM40Q8WWA1 233 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 GINS2Q9Y248 185 aa30.27■■■□□ 2.44
TPGS1-201ENST00000359315 SLITRK3O94933 977 aa30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 NME8Q8N427 588 aa30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR10Q9NXD2 777 aa30.26■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 M0QZ92 97 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEB2O15479 319 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF15O94989 841 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 CD52P31358 61 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 KIZQ2M2Z5 673 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf19Q8IY42 314 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 SNX21Q969T3 373 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 HSD17B14Q9BPX1 270 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 SUGCTQ9HAC7 445 aa30.25■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TECP42680 631 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 RAB30Q15771 203 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM266Q2M3C6 531 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TPH2Q8IWU9 490 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 GUCD1Q96NT3 240 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA6BQ9H3T3 888 aa30.24■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 KAT6AQ92794 2004 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 GPR32O75388 356 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01599Q8WXQ3 324 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 OSMRQ99650 979 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 CYP26B1Q9NR63 512 aa30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087WWV3 80 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 YWHABP31946 246 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
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