RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356940.10

RAB18-201, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB18, Length 4,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18-201ENST00000356940 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 HOOK2Q96ED9 719 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RAB20Q9NX57 234 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.67□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TTI1O43156 1089 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 CIB2O75838 187 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 BBOX1O75936 387 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 BMP3P12645 472 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 AP3B2Q13367 1082 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ANKS1AQ92625 1134 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 AZI2Q9H6S1 392 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 UCHL3P15374 230 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PRLRP16471 622 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 USP38Q8NB14 1042 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 CD19P15391 556 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RASA1P20936 1047 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PEX19P40855 299 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TRPC3Q13507 836 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 NARFQ9UHQ1 456 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 CDK17Q00537 523 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PTK2Q05397 1052 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 MUM1Q2TAK8 710 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RFFLQ8WZ73 363 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ACCSQ96QU6 501 aa11.66□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 AKR1B1P15121 316 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SLC9A1P19634 815 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TMOD1P28289 359 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RWDD2BP57060 319 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RPAINQ86UA6 219 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TMEM206Q9H813 350 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PEAK1Q9H792 1746 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 A0A087X0T9 212 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SERPINB2P05120 415 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 FAM228BP0C875 321 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TMED2Q15363 201 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 AOC3Q16853 763 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SMIM5Q71RC9 77 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 NLRX1Q86UT6 975 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 ALAS1P13196 640 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 SESN3P58005 492 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 PALM2Q8IXS6 379 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 BANK1Q8NDB2 785 aa11.65□□□□□ -0.54
RAB18-201ENST00000356940 RPS6KA4O75676 772 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 ABL1P00519 1130 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TRIM49P0CI25 452 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TRIM49CP0CI26 452 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 ALDH1B1P30837 517 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 PTGISQ16647 500 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 FAM182BQ5T319 152 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.65□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 KLRK1P26718 216 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CENPPQ6IPU0 288 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CACNA1FO60840 1977 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CCDC160A6NGH7 325 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 STAMBPO95630 424 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 FAM107AO95990 144 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 GALCP54803 685 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 GPC5P78333 572 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 BFSP1Q12934 665 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 FAM20AQ96MK3 541 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.64□□□□□ -0.55
RAB18-201ENST00000356940 VCXQ9H320 206 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms