RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HSPA2P54652 639 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CYP4A11Q02928 519 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ART3Q13508 389 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KRT80Q6KB66 452 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 UBE4BO95155 1302 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CYP21A2P08686 494 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ABCA6Q8N139 1617 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PSMA2P25787 234 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SESN3P58005 492 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K10Q02779 954 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ACAP3Q96P50 834 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LGALS16A8MUM7 142 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK13O15264 365 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PRELPP51888 382 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPARCL1Q14515 664 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 BCS1LQ9Y276 419 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ABL1P00519 1130 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MX2P20592 715 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SESTD1Q86VW0 696 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CLIC4Q9Y696 253 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EFCAB14O75071 495 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB2P05120 415 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GCKP35557 465 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB4P48594 390 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MFAP3LO75121 409 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ATP1A2P50993 1020 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RASGRF1Q13972 1273 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ALX1Q15699 326 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MASTLQ96GX5 879 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ALKQ9UM73 1620 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ACAD11Q709F0 780 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PIGSQ96S52 555 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 UTYO14607 1347 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CYP2C19P33261 490 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EFNA5P52803 228 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 GPR162Q16538 588 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC31Q6UY01 552 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FGD4Q96M96 766 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF521Q96K83 1311 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KAZNQ674X7 775 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 CCNYQ8ND76 341 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 STXBP3O00186 592 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NR3C1P04150 777 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NNTQ13423 1086 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP10Q86W26 655 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TTC8Q8TAM2 541 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 FGGP02679 453 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TMED2Q15363 201 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 URGCPQ8TCY9 931 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 COL15A1P39059 1388 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 KCNJ6P48051 423 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-201ENST00000356100 RBL2Q08999 1139 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms