RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SORBS3O60504 671 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ZBED6P86452 979 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 KCNMA1Q12791 1236 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 PPIL2Q13356 520 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 FIGNQ5HY92 759 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
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ACTB-201ENST00000331789 C4orf19Q8IY42 314 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ACRBPQ8NEB7 543 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 OPTNQ96CV9 577 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 SENP7Q9BQF6 1050 aa19.71■□□□□ 0.75
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ACTB-201ENST00000331789 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 BACH1O14867 736 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 CNMDO75829 334 aa19.7■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 ETF1P62495 437 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 USO1O60763 962 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 STAM2O75886 525 aa19.69■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 IWS1Q96ST2 819 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 FBXO40Q9UH90 709 aa19.69■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.742e-13■■□□□ 12.1
ACTB-201ENST00000331789 CASP4P49662 377 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SP2Q02086 613 aa19.68■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 MEA1Q16626 185 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 XKR9Q5GH70 373 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 FRMD5Q7Z6J6 570 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 DNERQ8NFT8 737 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 RDM1Q8NG50 284 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 LZTFL1Q9NQ48 299 aa19.68■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 CDHR1Q96JP9 859 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 STRA6Q9BX79 667 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 TXNRD2Q9NNW7 524 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SLC9A2Q9UBY0 812 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 IQCA1LA6NCM1 817 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 KCNH2Q12809 1159 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SWSAP1Q6NVH7 229 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 ANO5Q75V66 913 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 IQCDQ96DY2 449 aa19.67■□□□□ 0.74
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ACTB-201ENST00000331789 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 FAM184BQ9ULE4 1060 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 UBE4BO95155 1302 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 ZNF862O60290 1169 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 Q3C1V9 767 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 LDLRAD1Q5T700 205 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 NEK11Q8NG66 645 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 GPRC5CQ9NQ84 441 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 RBPJLQ9UBG7 517 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 POTEB2H3BUK9 544 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 K7ENM7 598 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R37O75864 691 aa19.66■□□□□ 0.74
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