RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 GLG1Q92896 1179 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 FAM167AQ96KS9 214 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 TIPINQ9BVW5 301 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM150BA6NC51 233 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PTGS1P23219 599 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R2P41236 205 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 NPEPPSP55786 919 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 UVSSAQ2YD98 709 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 AFG1LQ8WV93 481 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 CEP170P1Q96L14 293 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 CYBAP13498 195 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 GAP43P17677 238 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 C1QTNF8P60827 252 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 STK4Q13043 487 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 STIM1Q13586 685 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 BECN2A8MW95 431 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 IKBKBO14920 756 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PPFIA4O75335 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PRCPP42785 496 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ADSSL1Q8N142 457 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 Q9Y3F1 56 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SMTNL1A8MU46 457 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 FAM13AO94988 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 AKR1A1P14550 325 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF131P52739 623 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM50Q86XT4 487 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PPME1Q9Y570 386 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 DGAT1O75907 488 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 LGALS2P05162 132 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 MMP3P08254 477 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 RSPH10BP0C881 870 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 MYL5Q02045 173 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 TLK2Q86UE8 772 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 HPS3Q969F9 1004 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PARVGQ9HBI0 331 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC71-201ENST00000321895 HIP1RO75146 1068 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 MAPK7Q13164 816 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 SFR1Q86XK3 245 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 TRPV1Q8NER1 839 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 A6NJR5 290 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 PSMA7O14818 248 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 PRMT2P55345 433 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 PAK1Q13153 545 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 DGKDQ16760 1214 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 MTERF2Q49AM1 385 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 DAW1Q8N136 415 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 DRC1Q96MC2 740 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 ADCY3O60266 1144 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 NCAPHQ15003 741 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 PLCB4Q15147 1175 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 RAET1EQ8TD07 263 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC71-201ENST00000321895 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms